Er waren twee voorgangers in de buurtschap Eerde en er werd dan ook wel gespoken over 'de Eerder molen'. De eerste molen wordt al in 1583 genoemd, ongetwijfeld een standerdmolen. Op 12 december 1747 waaide deze om.

De tweede molen werd in 1748 gebouwd, niet op dezelfde plaats maar meer richting Besthem. In 1861 verbrandde er in de buurt van Ommen een molen, aan te nemen de voorganger van de huidige.
De Dordrechtsche Courant van 10-09-1861 bericht hierover: "In dienzelfden [vrijdag 6 sept.] avond is door het onweder in de gemeente Ambt Ommen een molen in de asch gelegd". Om wat voor type molen het ging, is niet bekend.

De huidige molen werd in 1862 gebouwd en weer op een andere plaats, dit omdat die locatie met paard en wagen beter bereikbaar was. In feite lag de nieuwe molen daar zeer mooi bij de splitsing van twee wegen. 

Rond 1950 was de Besthemer molen voor het laatst op windkracht in bedrijf; daarna raakte hij sterk in verval en rond 1980 was dit niet veel meer dan een ruïne. Een ruïne bovendien die door de omringde begroeiing inmiddels geheel en al uit het zicht was verdwenen. 

De zeer noodzakelijke restauratie voltrok zich niet in één keer. In 1981 werd, nadat de restanten van kap en wiekenkruis waren verwijderd, begonnen met het achtkant. Dat bleek toen dermate slecht, dat tenminste drie stijlen moesten worden vervangen. Dat gold ook diverse veldkruisen, regels en vloeren. Hierna werd de romp van een geheel nieuw rietdek voorzien. 

In 1995 volgden kap, wiekenkruis en meer dan dat: ook het bovenwiel moet toen grotendeels zijn vernieuwd. Vervolgens werd de molen draaivaardig opgeleverd: ondanks de aanwezigheid van enige (los bewaarde) molenstenen werd nog geen binnenwerk aangebracht. Vermoedelijk heeft de ervaring met de molen van Vilsteren, die wel geheel maalvaardig was gemaakt maar waar vervolgens een speciaal opgezet speltproject failliet ging, hieraan bijgedragen.

Evenwel kwam men later op deze beslissing terug: in de zomer van 2009 werd serieus begonnen en in 2010 had de molen één maalvaardig koppel 17der blauwe stenen. Let wel: met twee originele stenen uit de molen zelf! De loper was los in de molen bewaard gebleven (en die heeft men met beton opgedikt); de ligger lag al tijden bij "Den Oord" en deed daar dienst als 'tafeltje' maar keerde dus terug naar zijn oorsprong. In de molen bevindt zich ook een (ongerestaureerd) koppel 15der stenen.

De molen draait zeer regelmatig.