Poldermolen D is een in 1635 gebouwde achtkante binnenkruier. Eerst maakte hij als ondermolen deel uit van een tijdelijke molengang bij Oudorp. Toen de Schermer verder droogviel, werd deze molen, nog in 1635, verplaatst naar de huidige locatie.
Hij bemaalde de 315 ha. grote polder D van de Schermer op de Noordervaart, die deel uitmaakt van de Schermerbinnenboezem.

De molen werd in 1875 vervijzeld en raakte in 1929, als gevolg van de elektrificatie van de bemaling, buiten gebruik. Nadien werd de voorboezem gedicht en tot weiland gemaakt.

In het voorjaar van 2002 werd bekend dat een subsidie is toegewezen door de Rijksdienst voor de Monumentenzorg en het VSB-fonds, bestemd voor het restaureren van alle 11 molens van de Schermer.
Voor Poldermolen D betekende dit: plaatsing van een nieuwe vijzel, onder- en vijzelwiel en het opnieuw graven van de 300 meter lange tocht naar de Noordervaart. Verder werd de Oud-Hollandse ophekking zoveel mogelijk gemaakt volgens oude bestekgegevens. Hiermee werd deze molen weer maalvaardig.

In 2019 is de houten vijzel geheel vernieuwd.