Molen D bemaalde vroeger met nog 10 molens de ca. 5560 ha. grote polder Geestmerambacht op de Raaksmaatsboezem, thans de Schermerboezem. De bouw van deze molen was een gevolg van het feit dat tussen 12 juni en 7 augustus 1867 een van de twee molens van de polder, die op het zuideinde van Broek op Langedijk stonden, geheel verbrandde.

Besloten werd een nieuwe molen te herbouwen op een plaats waar een betere windvang aanwezig was; deze moest volgens de voorwaarden van de brandverzekeringsmaatschappij echter wel in dezelfde gemeente zijn gelegen. Zo viel de keuze op de huidige plaats, in de noordoosthoek van de toenmalige gemeente Broek op Langedijk gelegen, waar de water- en windtoevoer geheel vrij waren. Vervolgens is onder leiding van C. Eecen Pzn, sinds 1868 timmerbaas van de polder en voordien molenmaker te Oudkarspel, in 1868 geheel in eigen beheer voor ca. ƒ 13.000,-- de huidige molen gebouwd.

Met de overige molens werd hij bij besluit van 21 mei 1913 stil gezet, om alleen nog bij hoog water te worden gebruikt. Als gevolg van het uitbreken van de Eerste Wereldoorlog werd dit besluit al in 1914 weer ongedaan gemaakt.
De molen is tot 1924 in bedrijf geweest en na een proefperiode van twee jaar stilstand met de overige molens in 1926 definitief buiten dienst gesteld. Plannen tot afbraak gingen niet door en in en kort na de Tweede Wereldoorlog is de molen nog enige tijd in gebruik geweest.

De molen is in 1974-1975 gerestaureerd en wordt sindsdien min of meer regelmatig in werking gesteld.

Ruud Vlug, tientallen jaren hier molenaar/bewoner, overleed op 14 januari 2023.