De Borgmolen bemaalde de voormalige polder De Nije Borgkrite. Vanaf 1954, toen een elektrisch gemaal werd geplaatst, was deze molen evenwel niet meer maalvaardig.

Lange tijd bleef de staat van onderhoud zeer behoorlijk, maar tenslotte ging de toestand sterk achteruit. Dit werd in de hand gewerkt door de demping van de boezemsloot: hierdoor klonk de grond hier en daar sterk in en kwam de molen scheef te staan. Die scheefstand nam op een zeker moment dusdanig toe dat moest worden ingegrepen: in oktober 2003 werden beide roeden gestreken.

Omdat handhaving op de oorspronkelijke plaats niet goed meer mogelijk was, werd in februari 2008 een begin gemaakt met een grote restauratie en overplaatsing. Het achtkant werd daartoe weggevoerd naar de werkplaats van molenmakerij Hiemstra.

Op 16 oktober 2008 werd het geheel gerestaureerde en opnieuw met riet beklede achtkant teruggeplaatst op het eiland, ca. 500 meter van de oorspronkelijke locatie.
Kort daarna was de molen maalvaardig, sindsdien is deze op vrijwillige basis regelmatig in bedrijf.